Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab42Q0PD08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab42Q0PD08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab42Q0PD08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms