Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spata18Q0P557 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Spata18Q0P557 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms