Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrioQ0KL02 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrioQ0KL02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrioQ0KL02 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms