Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnnm1Q0GA42 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnnm1Q0GA42 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms