Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Runx2Q08775 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Runx2Q08775 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Runx2Q08775 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Runx2Q08775 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms