Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ebf1Q07802 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf1Q07802 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ebf1Q07802 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms