Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp2Q06649 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp2Q06649 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp2Q06649 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms