Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cab39Q06138 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cab39Q06138 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cab39Q06138 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms