Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hspg2Q05793 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms