Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcn1Q05186 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rcn1Q05186 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rcn1Q05186 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms