Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sox12Q04890 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sox12Q04890 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sox12Q04890 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms