Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RelbQ04863 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms