Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23aQ01405 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23aQ01405 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms