Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmgcrQ01237 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HmgcrQ01237 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms