Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde1bQ01065 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde1bQ01065 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms