Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga4Q00651 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga4Q00651 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms