Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx2Q00262 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx2Q00262 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms