Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfcP97953 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfcP97953 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfcP97953 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VegfcP97953 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfcP97953 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfcP97953 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfcP97953 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfcP97953 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms