Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smn1P97801 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smn1P97801 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smn1P97801 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms