Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AlkP97793 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AlkP97793 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AlkP97793 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
AlkP97793 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
AlkP97793 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AlkP97793 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AlkP97793 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AlkP97793 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AlkP97793 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AlkP97793 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AlkP97793 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AlkP97793 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AlkP97793 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AlkP97793 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
AlkP97793 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AlkP97793 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AlkP97793 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AlkP97793 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AlkP97793 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AlkP97793 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AlkP97793 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
AlkP97793 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
AlkP97793 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
AlkP97793 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
AlkP97793 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
AlkP97793 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
AlkP97793 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AlkP97793 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AlkP97793 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AlkP97793 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AlkP97793 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AlkP97793 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AlkP97793 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AlkP97793 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AlkP97793 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AlkP97793 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AlkP97793 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AlkP97793 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
AlkP97793 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AlkP97793 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AlkP97793 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AlkP97793 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AlkP97793 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AlkP97793 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AlkP97793 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
AlkP97793 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AlkP97793 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AlkP97793 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AlkP97793 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AlkP97793 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AlkP97793 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AlkP97793 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AlkP97793 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AlkP97793 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AlkP97793 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms