Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cry1P97784 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cry1P97784 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cry1P97784 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cry1P97784 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cry1P97784 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cry1P97784 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cry1P97784 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cry1P97784 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cry1P97784 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cry1P97784 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cry1P97784 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cry1P97784 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms