Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited1P97769 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited1P97769 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited1P97769 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cited1P97769 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cited1P97769 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms