Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcc1P97496 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarcc1P97496 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms