Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec1P97353 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec1P97353 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec1P97353 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec1P97353 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec1P97353 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec1P97353 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec1P97353 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms