Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nkx2-3P97334 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx2-3P97334 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms