Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mesp1P97309 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp1P97309 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mesp1P97309 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms