Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr1bP70700 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr1bP70700 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms