Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctps1P70698 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctps1P70698 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms