Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sparcl1P70663 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sparcl1P70663 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms