Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msx3P70354 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx3P70354 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Msx3P70354 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx3P70354 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msx3P70354 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms