Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp4P70343 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp4P70343 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp4P70343 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp4P70343 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp4P70343 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp4P70343 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms