Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frat1P70339 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Frat1P70339 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frat1P70339 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frat1P70339 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frat1P70339 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frat1P70339 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frat1P70339 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms