Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tbx6P70327 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx6P70327 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbx6P70327 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms