Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Aup1P70295 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Aup1P70295 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Aup1P70295 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aup1P70295 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aup1P70295 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Aup1P70295 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms