Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf6P70279 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf6P70279 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf6P70279 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Surf6P70279 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf6P70279 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Surf6P70279 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf6P70279 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms