Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl8P62918 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl8P62918 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl8P62918 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms