Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl30P62889 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl30P62889 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl30P62889 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl30P62889 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl30P62889 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl30P62889 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms