Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbx1P62878 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbx1P62878 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbx1P62878 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms