Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gnb1P62874 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gnb1P62874 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gnb1P62874 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms