Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou3f4P62515 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f4P62515 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms