Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf13P61216 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf13P61216 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf13P61216 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf13P61216 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf13P61216 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf13P61216 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms