Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sem1P60897 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sem1P60897 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sem1P60897 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sem1P60897 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms