Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Csrnp3P59055 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Csrnp3P59055 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms