Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm1P58771 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm1P58771 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm1P58771 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms