Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P58686 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P58686 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P58686 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P58686 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P58686 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P58686 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P58686 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P58686 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P58686 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P58686 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P58686 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P58686 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P58686 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P58686 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P58686 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P58686 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P58686 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P58686 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P58686 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P58686 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P58686 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P58686 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P58686 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P58686 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P58686 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P58686 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P58686 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P58686 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P58686 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P58686 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P58686 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P58686 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P58686 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P58686 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P58686 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P58686 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P58686 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P58686 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms