Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setd4P58467 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd4P58467 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd4P58467 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setd4P58467 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd4P58467 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd4P58467 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Setd4P58467 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setd4P58467 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms