Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtdsplP58465 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtdsplP58465 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms