Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpaP58389 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpaP58389 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpaP58389 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpaP58389 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpaP58389 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpaP58389 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms