Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opa1P58281 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opa1P58281 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Opa1P58281 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opa1P58281 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opa1P58281 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opa1P58281 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms