Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dpf3P58269 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms